Level DNA Cacar Monyet Berkorelasi dengan Infektivitas Virus

Read Also

Infeksi manusia monkeypox virus (MPXV) pertama dari wabah saat ini dilaporkan di Inggris pada Mei 2022. Sejak itu, jumlah kasus infeksi MPXV terus meningkat di seluruh dunia.

Wabah MPXV saat ini terutama terkonsentrasi pada pria yang melakukan aktivitas seksual dengan pria lain (LSL). Hingga saat ini, lebih dari 53.000 kasus MPXV telah dilaporkan dari wabah saat ini, yang semuanya dikaitkan dengan MPXV Clade II.

Latar belakang

MPXV adalah virus zoonosis double-stranded deoxyribonucleic acid (DNA)yang termasuk dalam famili Poxviridae dari genus Orthopoxvirus. Infeksi manusia MPXV dilaporkan di Afrika tengah untuk pertama kalinya pada tahun 1970.

Selanjutnya, beberapa wabah sporadis dilaporkan di Afrika Tengah dan Barat. Pada tahun 2003, wabah MPXV di luar Afrika tercatat untuk pertama kalinya dan disebabkan oleh impor hewan eksotik dari Afrika.

Selama wabah saat ini, individu telah melaporkan lesi kulit/mukosa pada daerah genital, perianal, dan/atau orofaringeal. Analisis Polymerase chain reaction (PCR) telah digunakan untuk mendeteksi infeksi MPXV.

Karena keberadaan DNA virus dalam spesimen klinis tidak menyiratkan infektivitas, para ilmuwan telah menguji sampel klinis pasien MPXV untuk menentukan hubungan antara salinan DNA MPXV dan status infeksi dalam studi Euro Surveillance baru-baru ini. Jumlah salinan DNA MPXV diukur melalui nilai PCR (quantitation cycle (Cq)), sedangkan status infeksi diukur dalam unit pembentukan plak (pfu)/mL menggunakan uji plak. Nilai threshold PCR yang mengindikasikan infeksi MPXV ditentukan dalam penelitian ini.

Tentang studi

Sebanyak empat puluh tiga sampel klinis, termasuk 21 swab orofaringeal, 20 swab eksudat lesi dermal, dan dua swab dubur, diperoleh dari tiga puluh dua pasien dari enam fasilitas medis di Israel. Sampel swab klinis disimpan hingga 48 jam dalam tabung yang berisi viral transport medium (VTM) pada suhu 4°C. Sampel ini menjadi sasaran kuantifikasi DNA virus, dengan titer virus menular selanjutnya diukur.

Nilai Cq untuk usapan orofaring relatif tinggi, dengan mayoritas sampel ini menunjukkan titer MPXV menular di bawah tingkat deteksi. Uji korelasi Pearson menentukan hubungan antara tingkat DNA virus di setiap sampel dan titer virus menular. Persamaan regresi linier digunakan untuk memprediksi nilai Cq yang terkait dengan virus tidak menular.

Temuan studi

Korelasi yang kuat dan negatif antara hasil PCR terkait dengan MPXV orofaringeal, swap rektal, lesi dermal, dan infektivitas virus pada sel yang dikultur menunjukkan infektivitas yang lebih tinggi pada spesimen dengan nilai Cq rendah.

Dalam evaluasi sampel lesi orofaring dan dermal berpasangan dari pasien yang sama, sebagian besar sampel lesi dermal dikaitkan dengan viral load yang lebih tinggi dan nilai Cq yang rendah dibandingkan dengan spesimen lesi orofaring. Hal ini menunjukkan bahwa lesi dermal menghadirkan risiko infektivitas yang lebih tinggi.

Nilai Cq lebih besar atau sama dengan 35 menunjukkan infeksi MPXV negatif atau minor. Temuan ini konsisten dengan penelitian sebelumnya yang melaporkan nilai Cq 29 dalam sampel air mani yang mengindikasikan orang tersebut telah berhasil pulih dari MPXV.

Meskipun penelitian ini memperkirakan rasio 172 salinan DNA/pfu, penelitian sebelumnya bertentangan dengan temuan ini dan melaporkan rasio 10-100 salinan DNA/pfu. Temuan kontradiktif ini dikaitkan dengan fakta bahwa penelitian saat ini memperkirakan keberadaan DNA virus daripada partikel infeksius. Selain itu, dibandingkan dengan virus yang berasal dari kultur, virus yang diisolasi dari sampel klinis mengalami penurunan infektivitas terhadap garis sel.

Menyimpan sampel hingga 48 jam sebelum analisis dapat memengaruhi hasil. Namun demikian, berdasarkan penelitian peneliti yang tidak dipublikasikan yang dilakukan di laboratorium yang sama, infektivitas poxvirus biasanya dipertahankan hingga 24 jam inkubasi pada suhu 4°C dan menunjukkan perubahan kecil setelah 48 jam inkubasi dalam kondisi serupa.

Keterbatasan

Penelitian saat ini memiliki beberapa keterbatasan, termasuk kebutuhan untuk analisis lebih lanjut dari usapan lesi tambahan dengan nilai Cq tinggi. Penelitian lebih lanjut juga diperlukan untuk menganalisis infektivitas virus dari sampel klinis lain yang kurang tersedia, seperti keropeng, usap dubur, dan air mani.

Para penulis tidak dapat mempertimbangkan waktu antara pengumpulan spesimen dan perkiraan tanggal infeksi. Variasi dalam metode yang digunakan untuk mengumpulkan sampel mungkin berdampak pada pemulihan DNA.

Kesimpulan

Secara keseluruhan, temuan penelitian menunjukkan korelasi kuat antara nilai MPXV Cq dan infektivitas virus. Lebih lanjut menyarankan bahwa nilai Cq lebih besar dari atau sama dengan 35 berhubungan dengan minor atau non-infektivitas.

Para peneliti dari studi saat ini merekomendasikan bahwa infeksi harus dievaluasi berdasarkan manifestasi klinis secara keseluruhan, seperti lokasi dan stadium lesi. Temuan ini dapat digunakan untuk mengembangkan pedoman dan tindakan perlindungan untuk pasien yang terinfeksi MPXV dan kontak dekat.

Journal reference:

Paran, N., Yahalom-Ronen, Y., Shifman, O., et al. (2022) Monkeypox DNA levels correlate with virus infectivity in clinical samples, Israel, 2022. Euro Surveillance 27(35). doi:10.2807/1560-7917.ES.2022.27.35.2200636