Flora Normal (Mikrobiota) Mulut dan Saluran Pencernaan

Read Also

Flora normal adalah mikroorganisme yang selalu ada di kulit dan selaput lendir setiap manusia tanpa menyebabkan infeksi pada individu yang sehat. Hanya bakteri dan jamur yang dianggap sebagai flora normal. Mereka hadir dalam kondisi yang relatif stabil, baik untuk jangka pendek atau tertentu atau sepanjang hidup individu. Komposisi mereka dapat bervariasi pada individu yang berbeda.

Saluran pencernaan (GI tract atau alimentary canal) adalah saluran dari sistem pencernaan untuk konsumsi makanan, pencernaan mekanik dan kimia, dan ekskresi limbah pencernaan. Ini adalah saluran dari mulut ke anus termasuk rongga mulut (bukal), orofaring, kerongkongan, lambung, usus kecil, dan usus besar. Berbagai bagian ini memiliki berbagai sifat fisikokimia, sehingga keragaman mikroflora ditemukan di saluran GI. Dari mulut hingga anus, setiap bagian saluran cerna penuh dengan berbagai spesies mikrobiota normal. Flora usus mengandung lebih dari 400 spesies bakteri.

Daftar Flora Normal Mulut dan Saluran Gastrointestinal

Gram-Positive Bacteria	Gram-Negative Bacteria	Others
Streptococcus spp. Lactobacillus spp. Staphylococcus spp. Clostridium spp. Bacillus spp. Corynebacterium spp. Actinomyces spp.  Propionibacterium spp. Rothia spp. Eubacterium spp. Gemella spp. Peptostreptococcus spp.	E. coli Klebsiella spp. Enterobacter spp. Enterococcus spp. Citrobacter spp. Vibrio spp. Campylobacter spp. Helicobacter pylori  Proteus spp. Fusobacterium spp. Neisseria spp. Moraxella spp. Kingella spp. Actinobacillus spp. Bacteroides spp. Porphyromonas spp. Prevotella spp. Selenomonas spp. Cardiobacterium spp. Eikenella spp. Veillonella spp.  Leminorella spp.  Morganella spp.  Providencia spp.  Yersinia spp.  Serratia spp.	Candida spp.

Flora Normal pada Lokasi Spesifik Mulut dan Saluran Gastrointestinal

Location	Normal Microflora
Mouth and teeth	Streptococcus spp., Neisseria spp., Lactobacillus spp., Veillonella spp., Staphylococcus spp., Peptostreptococcus spp., Treponema spp.,
Oropharynx	Peptostreptococcus spp., Veillonella spp., Actinomyces spp., Fusobacterium spp., Streptococcus spp., Corynebacterium spp., Lactobacillus spp., Neisseria spp., Staphylococcus spp., Gemella spp., Moraxella spp., Kingella spp., Cardiobacterium spp., Eikenella spp., Actinobacillus spp., Propionibacterium spp., Bacteroides spp., Porphyromonas spp., Rothia spp., Prevotella spp., Selenomonas spp.,
Esophagus	Streptococcus spp., Candida spp., Bacteroides spp.,
Stomach	Lactobacillus spp., Streptococcus spp., Helicobacter pylori
Small Intestine	Lactobacillus spp., Streptococcus spp., Peptostreptococcus spp., Porphyromonas spp., Prevotella spp.,
Large Intestine	Bifidobacterium spp., Bacteroides spp., Eubacterium spp., Enterococcus spp., E. coli, Citrobacter spp., Klebsiella spp., Enterobacter spp., Proteus spp., Streptococcus spp., Actinomyces spp., Peptostreptococcus spp., Gemella spp., Bacillus spp., Clostridium spp., Vibrio spp., Fusobacterium spp., Porphyromonas spp., Prevotella spp., Leminorella spp., Morganella spp., Providencia spp., Yersinia spp., Serratia spp.,

Bakteri Gram +ve dan Gram -ve Mulut dan Saluran Gastrointestinal

Staphylococcus spp.

• Gram-positif
• Katalase-positif
• Koagulase positif dan koagulase-negatif
• Aerobik
• bakteri kokus
• keluarga Staphylococcaceae,
• Dikenal karena menghasilkan kelompok seperti anggur di bawah mikroskop
• Stafilokokus adalah flora sementara di mulut dan orofaring.

S. epidermidis dan S. aureus merupakan spesies yang paling dominan di mulut dan orofaring. Mereka terutama hadir pada anak-anak. S. epidermidis masuk ke rongga hidung dan mulut saat lahir dari kulit vagina. Selama menyusui, S. epidermidis dipindahkan ke mulut dari kulit payudara ibu.

Streptokokus spp.

• Gram-positif
• Anaerobik dan anaerobik fakultatif
• Katalase-negatif
• bakteri kokus
• Keluarga – Streptococcaceae
• Susunan khas sel dalam bentuk rantai bola di bawah mikroskop
• Mereka hadir di setiap bagian saluran GI. Mereka sebagian besar dianggap sebagai flora sementara.

S. agalactiae (Grup B Streptococci), S. mutans, S. mitis, S. oralis, S. parasanguis, S. sanguis, S. salivarius, S. cristatus, S. constellatus, S. anginosus group (viridans Streptococci), dll. adalah spesies yang sering dilaporkan di saluran GI.

Spesies Streptokokus yang toleran asam seperti galur S. anginosus yang toleran asam juga ditemukan di perut.

Clostridium sp.

• Gram-positif
• berbentuk batang
• Benar-benar anaerobik
• Bakteri pembentuk spora
• Keluarga – Clostridiaceae

Cluster Clostridium XIVa dan IV adalah bakteri komensal yang dominan di usus, mencakup sekitar 10 – 40% dari total bakteri usus. C. aerotolerans, C. aminophilus, C. aminovalericum, C. clostridiiforme, C. coccoides, C. nexile, C. oroticum, C. polysaccharolyticum, C. symbiosum, C. leptum, C. difficile strain 630, C. sordelli, C. absonum, C. butyricum, C. paraputrificum, C. xylanolyticum, dll. adalah spesies umum di usus manusia.

Clostridium perfringens juga merupakan flora normal usus halus dan usus besar.

Bacillus sp.

• Gram-positif
• berbentuk batang
• Motil
• Obligat aerobik dan beberapa anaerobik fakultatif
• Pembentukan spora
• Keluarga – Bacilaceae
• B. clausii, B. licheniformis, B. coagulans adalah beberapa flora usus yang umumnya terisolasi.

Corynebacterium sp.

• Gram-positif
• Berbentuk batang (berbentuk klub),
• Bakteri aerob
• Keluarga – Corynebacteriaceae

Fitur karakteristik asam mesodiaminopimelic tinggi dan arabinogalactan yang sangat berulang

C. matruchotii adalah penghuni normal rongga mulut. Spesies Corynebacterium juga ditemukan di usus besar.

Actinomyces sp.

• Gram-positif
• Berbentuk batang (bercabang)
• Anaerobik obligat dan anaerob fakultatif
• Pembentukan endospora
• Keluarga – Actinomycetaceae

A. kental, A. naeslundii, A. israelii, dll banyak ditemukan di mulut. Beberapa spesies juga ditemukan di usus kecil dan usus besar sebagai flora sementara.

Helicobacter pylori

• Gram-negatif
• Spiral
• Mikroaerofilik
• Epsilonproteobacteria
• Keluarga – Helicoceteriaceae

Mereka diadaptasi untuk mentolerir keasaman lambung manusia. Mereka adalah flora normal lambung dan duodenum.

Fusobacterium sp.

• Gram-negatif
• Anaerobik
• Tidak berspora
• Berbentuk batang dengan ujung runcing
• Keluarga – Fusobacteriaceae

Fusobacterium sp. merupakan flora normal mulut dan usus. Mereka ditemukan dalam jumlah yang relatif kecil. F. nucleatum ditemukan di dalam mulut.

Propionibacterium sp.

• Gram-positif
• berbentuk batang
• Anaerobik
• Keluarga – Propionibacteriaceae

Kemampuan unik untuk menghasilkan asam propionat menggunakan enzim transkarboksilase

Propionibacterium sp. merupakan flora normal di usus besar. P. acidifaciens dan P. propionicus hadir di rongga mulut orang yang relatif sangat sedikit.

Campylobacter sp.

• Gram-negatif
• Berbentuk S (berbentuk koma)
• Mikroaerofilik
• Motil
• Tidak berspora
• Keluarga – Campylobacteriaceae

Campylobacter sp. ditemukan di usus besar dan mulut. C. dahak, C. coli. C. upsaliensis, dll. adalah beberapa spesies Campylobacter komensal.

Rotia spp.

• Gram-positif
• berbentuk batang
• Non-motil
• Bakteri aerob
• Keluarga – Micrococcaceae

Mereka adalah flora normal mulut dan saluran pernapasan. R. mucilaginosa, R. dentocariosa adalah flora normal mulut. Rotia spp. juga diisolasi dari ileum distal dan bahkan di lambung.

Actinobacillus sp.

• Gram-negatif
• Berbentuk batang atau lonjong (coccobacilli)
• Non-motil
• Tidak berspora
• Anaerobik fakutatif atau aerobik

A. actinomycetemcomitans adalah mikroflora mulut manusia.

Eubacterium sp.

• Gram-positif
• Batang pleomorfik
• Aerobik atau anaerobik
• Bakteri motil atau non-motil
• Keluarga – Eubacteriaceae

Eubacterium adalah mikroflora normal mulut dan saluran pencernaan. Mereka adalah salah satu spesies anaerobik yang dominan di usus; genera bakteri paling melimpah kedua di usus besar. E. aerofaciens, E. cylindroides, E. lentum, dan E. rectale adalah spesies yang paling umum di usus besar.

Gemela spp.

• gram positif,
• Anaerobik fakultatif
• Bakteri diplokokus
• Keluarga – Staphylococcaceae

Gemella adalah spesies umum di rongga mulut dan usus manusia.

Peptostreptococcus spp.

• Gram-positif
• Bulat (berpasangan atau rantai)
• Anaerobik
• Tidak berspora
• Motil
• Keluarga – Peptostreptococcaceae

Peptostreptococcus adalah salah satu bakteri anaerobik yang paling melimpah di saluran pencernaan manusia. P. intermedius adalah spesies dominan di usus manusia.

Lactobacillus sp.

• Gram-positif
• berbentuk batang
• Non-motil
• Tidak berspora
• Anaerobik atau Mikroaerofilik
• Bakteri fermentasi asam laktat (BAL)
• Keluarga – Lactobacillaceae

Mereka adalah flora normal mulut, saluran pencernaan, dan saluran reproduksi wanita. Lebih dari 50 spesies Lactobacillus ditemukan di usus manusia yang sehat. L. casei, L. delbruckeii, L. murinus, L. plantarum, L. rhamnosus, dan L. ruminus adalah spesies yang paling melimpah.

E. coli

• Gram-negatif
• berbentuk batang
• Motil
• Fermentasi laktosa
• Anaerobik fakultatif
• Bakteri koliform mesofilik
• Keluarga – Enterobacteriaceae
• Genus – Escherichia

Strain non-patogen E. coli adalah salah satu spesies mikroflora aerobik yang paling umum dari usus manusia.

Klebsiella spp.

• Gram-negatif
• berbentuk batang
• Non-motil
• Dienkapsulasi
• Fermentasi laktosa
• Anaerobik fakultatif
• Bakteri koliform mesofilik
• Keluarga – Enterobacteriaceae

Menjadi anggota Enterobacteriaceae, itu umum di usus vertebrata termasuk manusia. K. oxytoca, K. pneumoniae ditemukan di usus.

Enterobacter sp.

• Gram-negatif
• berbentuk batang
• Motil
• Fermentasi laktosa
• Anaerobik fakultatif
• Bakteri koliform mesofilik
• Keluarga – Enterobacteriaceae

Enterobacter adalah mikroflora normal pada usus halus dan usus besar. E. cloacae, E. ludwigii, E. hormaechei, E. cancerogenus, E. massiliensis adalah komensal di usus.

Citrobacter sp.

• Gram-negatif
• berbentuk batang
• Fermentasi laktosa
• Sebagian besar motil, sedikit non-motil
• Coliform
• Gammaproteobacteria
• Keluarga – Enterobacteriaceae
• Kemampuan khusus untuk menggunakan sitrat sebagai satu-satunya sumber karbon

Citrobacter adalah flora normal saluran pencernaan manusia. C. freundii, C. europaeus, C. koseri, C. sedlaki, C. werkmanii, C. gillenii, C. braakii, C. murliniae adalah komensal usus manusia.

Vibrio spp.

• Gram-negatif
• Berbentuk batang (berbentuk koma)
• Motil
• Tidak berspora
• Anaerob fakultatif
• Gammaproteobacteria
• Keluarga – Vibrionaceae
• Karakteristik 2 kromosom

V. parahaemolyticus ditemukan pada sedikit orang. V. sputorum hadir di mulut beberapa orang sebagai mikroflora normal.

Proteus sp.

• Gram-negatif
• berbentuk batang
• Aerobik dan anaerobik fakultatif
• Bakteri motil
• Keluarga – Enterobacteriaceae
• Kapasitas untuk menghasilkan koloni yang berkerumun

P. vulgaris, P. mirabilis, dan P. penneri terdapat di saluran cerna manusia, tetapi dalam jumlah yang sangat rendah hanya sekitar 0,05% dari total mikroflora usus.

Enterococcus spp.

• Gram-positif
• Anaerobik fakultatif
• Fermentasi laktosa
• Bakteri kokus (diplokokus)
• Keluarga – Enterococcaceae
• Kapasitas untuk mentolerir konsentrasi garam empedu hingga 40%

Enterococci adalah komensal dari saluran GI. E. faecalis dan E. faecium adalah spesies Enterococcus yang paling umum di usus manusia.

Leminorella spp.

• Gram-negatif
• berbentuk batang
• Gammaproteobacteria
• Keluarga – Enterobacteriaceae

Leminorella adalah genus baru dalam keluarga Enterobacteriaceae. L. richardii dan L. grimontii menjajah saluran GI manusia.

Providencia spp.

• Gram-negatif
• berbentuk batang
• Motil
• Gammaproteobacteria
• Keluarga – Morganellaceae

Providencia hadir sebagai flora usus normal dalam jumlah yang relatif rendah pada beberapa orang. P. rettgeri, P. alaclifaciens, P. rustigianii adalah beberapa spesies yang umum.

Yersinia spp.

• Gram-negatif
• Coccobacilli
• Anaerob fakultatif
• Gammaproteobacteria
• Keluarga – Yersiniaceae

Yersinia ditemukan di usus kecil dan besar manusia. Y. aleksiciae, Y. bercovieri, Y. enterocolitica, Y. frederiksenii, Y. rohdei, Y. kristensenii adalah spesies Yersinia umum yang berkoloni di saluran pencernaan manusia.

Bacteroides sp.

• Gram-negatif
• berbentuk batang
• Tahan empedu
• Tidak berspora
• Motil atau non-motil
• Anaerobik obligate
• Keluarga – Bacteroidaceae

Bacteroides adalah bagian dari mikroflora saluran cerna manusia. B. gingivalis, B. intermedius, B. fragilis, B. pneumosintes, B. melaninogenicus, dan B. thetaiotaomicron adalah beberapa spesies umum di mulut dan usus besar.