Respiratory Microbiota - Flora Normal Saluran Pernapasan

Read Also

Flora normal adalah mikroorganisme yang terdapat pada kulit dan selaput lendir setiap manusia dalam keadaan yang relatif stabil tanpa menyebabkan penyakit/infeksi pada individu yang sehat. Mereka hadir baik sepanjang hidup untuk waktu yang singkat.

Saluran pernapasan dapat dibagi menjadi upper respiratory tract (URT) dan lower respiratory tract (LRT). URT dihuni oleh beragam kelompok bakteri komensal dan spesies jamur. LRT biasanya steril dan bebas dari mikrobiota normal.

Daftar Flora Normal Saluran Pernapasan

Gram-Positive Bacteria	Gram-Negative Bacteria	Others Microbes
Streptococcus spp. Staphylococcus spp. Corynebacterium spp. Haemophilus spp. Fusobacterium spp. Propionibacterium spp. Rothia spp. Actinobacillus spp. Eubacterium spp. Gemella spp. Peptostreptococcus spp.	E. coli Proteus spp. Neisseria spp. Moraxella spp. Kingella spp. Bacteroides spp. Porphyromonas spp. Prevotella spp. Selenomonas spp. Cardiobacterium spp. Eikenella spp. Veillonella spp.	Candida spp. Mycoplasma spp.

Flora Normal pada Lokasi Tertentu Saluran Pernafasan

Location of Respiratory Tract	Normal Microflora
Nares	Staphylococcus spp., Corynebacterium spp., Peptostreptococcus spp., Fusobacterium spp.
Nasopharynx	Streptococcus spp., Corynebacterium spp., Neisseria spp., Moraxella spp., Kingella spp., Haemophilus spp.
Oropharynx	Peptostreptococcus spp., Veillonella spp., Actinomyces spp., Fusobacterium spp., Streptococcus spp., Corynebacterium spp.,  Lactobacillus spp., Neisseria spp., Staphylococcus spp., Gemella spp., Moraxella spp., Kingella spp., Cardiobacterium spp., Eikenella spp., Actinobacillus spp., Propionibacterium spp., Bacteroides spp., Porphyromonas spp., Rothia spp., Prevotella spp., Selenomonas spp., Eubacterium spp., Mycoplasma spp., Candida spp.
Lower Respiratory Tract	NONE

Bakteri Gram +ve dan Gram-ve Mikrobiota Pernapasan

Staphylococcus spp.

• Gram-positif
• Katalase-positif
• bakteri kokus
• Keluarga- Staphylococcaceae
• Cluster seperti anggur yang khas di bawah mikroskop

Staphylococci adalah flora aerobik yang paling melimpah dari saluran hidung. Mereka ditemukan di saluran hidung lebih dari 90% orang.

S. epidermidis adalah flora normal kulit dan banyak terdapat di kulit bagian anterior nares. Hal ini hadir di nares anterior sekitar 90% dari individu.

S. aureus hadir di saluran hidung sekitar 30% individu. Methicillin-Resistant S. aureus (MRSA) juga ditemukan sebagai komensal di rumah sakit dan petugas kesehatan.

S. lugdunensis, S. capitis, S. haemolyticus, S. warneri, S. hominis, S. cohnii, dan S. auricularis adalah spesies lain yang ditemukan sebagai komensal di nares anterior dan rongga hidung sekitar <10% orang.

Corynebacterium sp.

• Gram-positif
• Berbentuk batang (berbentuk klub)
• Bakteri aerob
• Keluarga- Corynebacteriaceae
• Corynebacteria banyak ditemukan sebagai bakteri aerob di daerah nares dan nasofaring.

C. accolens dan C. propinquum adalah Corynebacteria dominan yang ada di nares, nasofaring, dan orofaring. Mereka menyumbang lebih dari 40% Corynebacteria di hidung.

C. pseudodiphtheriticum, C. jeikeium, C. macginleyi adalah Corynebacteria umum lainnya dari saluran hidung.

Propionibacterium sp.

• Gram-positif
• berbentuk batang
• Bakteri anaerob
• Keluarga – Propionibacteriaceae
• Kemampuan karakteristik untuk mensintesis asam propionat
• Propionibacterium sp. adalah spesies anaerobik yang paling melimpah di mikrobiota hidung dewasa.

P. acnes adalah spesies yang paling melimpah dalam genus ini yang mencakup sekitar 50 – 70% bakteri anaerob di saluran hidung.

P. acidifaciens dan P. propionicus adalah spesies lain dari flora hidung normal pada sebagian kecil orang.

Peptostreptococcus spp.

• Gram-positif
• Bulat (kokus)
• Non-motil
• Bakteri anaerob
• Keluarga – Peptostreptococcaceae
• P. anaerobius, P. asaccharolyticus, P. micros adalah spesies umum di orofaring.

Fusobacterium sp.

• Gram-negatif
• Tidak berspora
• berbentuk batang
• Bakteri anaerob
• Keluarga – Fusobacteriaceae.
• Mereka banyak terdapat di nares anterior, nasofaring, dan orofaring.

Subspesies F. nucleatum, F. necrophorum, F. peridonticum adalah spesies yang paling umum di orofaring dan nasofaring.

Streptococcus spp.

• Gram-positif
• Anaerobik dan anaerobik fakultatif
• Katalase-negatif
• bakteri kokus
• Keluarga – Streptococcaceae
• Susunan karakteristik dalam bentuk rantai bola
• Streptococci adalah genus bakteri yang tersebar luas di nasofaring dan orofaring.

S. salivarius, S. sanguis, S. mutans, S. vestibularis, S. pneumoniae, dan S. parasanguis adalah mikrobiota normal di daerah faring.

Neisseria spp.

• Gram-negatif
• Aerobik atau anaerobik fakultatif
• Kokus (dan diplokokus)
• Betaproteobakteri
• Keluarga – Neisseriaceae
• Neisseria adalah komensal ke nasofaring dan orofaring. 12 spesies Neisseria ditemukan dari daerah nasofaring.

N. meningitidis adalah komensal yang sangat umum di daerah nasofaring. Ini juga merupakan patogen invasif dan potensial yang berhubungan dengan meningitis.

N. lactamica, N. subflava, N. mukosa, N. sicca adalah spesies umum di URT.

Haemophilus sp.

• Gram-negatif
• Coccobacilli (pleomorfik)
• Aerobik atau anaerobik fakultatif
• Gammaproteobacteria
• Keluarga – Pasteurellaceae
• Spesies Haemophilus adalah flora normal saluran pernapasan bagian atas, rongga mulut, saluran pencernaan bagian bawah, dan vagina.

Strain H. influenzae non-capsulated dan Nontypable H. influenzae adalah spesies Haemophilus yang umum di nasofaring. H. aphrophilus, H. hemolyticus, H. parainfluenzae juga ditemukan sebagai komensal pada kelompok bawah orang di daerah nasofaring dan orofaring.

Moraxella sp.

• Gram-negatif
• Coccobacilli (basil atau diplococci dalam beberapa),
• Benar-benar aerobik
• Gammaproteobacteria
• Keluarga – Moraxellaceae

M. catarrhalis adalah penghuni normal saluran pernapasan bagian atas di faring. Ini lebih sering ditemukan pada anak-anak (~50%) dan orang yang lebih tua dari 60 tahun (~26%), dibandingkan pada orang dewasa (~6%).

M. nonliquefaciens dan M. lincolnii juga ditemukan di nasofaring beberapa orang sebagai komensal.

Kingella spp.

• Gram-negatif
• Anaerobik fakultatif
• Non-motil
• Coccobacilli
• Rewel
• Betaproteobakteri
• Keluarga – Neisseriaceae

K. kingae adalah bakteri umum di nasofaring anak-anak. K. indologenes dan K. denitrificans adalah spesies komensal lain di orofaring beberapa anak dan orang dewasa yang sehat.

Veillonella spp.

• Gram-negatif
• fermentasi laktat,
• Anaerobik
• bakteri kokus
• Keluarga – Veillonellaceae
• Mereka adalah bakteri anaerobik umum di orofaring.

Actinomyces sp.

• gram positif,
• Anaerobik fakultatif (beberapa anaerobik ketat),
• berbentuk batang,
• pembentuk spora
• Aktinobakteri
• Keluarga – Actinomycetaceae

A. meyeri, A. israelii, A. turicensis adalah spesies umum yang dilaporkan dari wilayah orofaring.

Gemela spp.

• gram positif,
• Anaerobik fakultatif
• Bakteri diplokokus
• Keluarga – Staphylococcaceae
• G. morbilorum dan G. sanguinis adalah komensal di daerah orofaring.

Cardiobacterium sp.

• Gram-negatif
• berbentuk batang
• Gammaproteobacteria
• Keluarga – Cardiobacteriaceae
• Biasanya terdapat di nasofaring dan orofaring. C. hominis biasanya dilaporkan dalam URT.

Eikenella spp.

• gram negatif,
• berbentuk batang,
• Anaerobik fakultatif
• Betaproteobakteri
• Keluarga – Neisseriaceae
• E. corrodens ditemukan di daerah mulut dan nasofaring.

Actinobacillus sp.

• Gram-negatif
• Coccobacilli
• Gammaproteobacteria
• Keluarga – Pasteurellaceae
• A. ureae dan A. hominis adalah komensal dari URT.

Bacteroides sp.

• Gram-negatif
• berbentuk batang
• Tidak berspora
• Wajib anaerobik
• Bakteri motil, atau nonmotil
• Keluarga – Bacteroidaceae.
• Mereka terutama ditemukan di orofaring.

Porphyromonas sp.

• gram negatif,
• berbentuk batang
• Tidak berspora,
• Bakteri anaerob
• Keluarga – Prophyromonadaceae

Mereka sebagian besar hadir di rongga mulut, tetapi juga merupakan flora normal sementara dari saluran pernapasan bagian atas, terutama orofaring. P. gingivalis, P. endodontalis, P. catoniae, P. pasteri adalah flora sementara yang umum pada URT.

Rotia spp.

• Gram-positif
• berbentuk batang
• Non-motil
• Bakteri aerob
• Keluarga – Micrococcaceae
• Mereka adalah flora normal mulut dan saluran pernapasan.

R. dentocarisa, R. mucilaginosa, R. aeria adalah flora normal sementara pada saluran pernapasan bagian atas.

Prevotella spp.

• Gram-negatif
• Coccobacilli
• Bakteri anaerob
• Keluarga – Prevotellaceae

Mereka adalah flora sementara saluran udara bagian bawah. P. melaninogenica, P. nanceiensis, dan P. salivae adalah spesies yang umum.

Selenomonas spp.

• Gram-negatif
• berbentuk bulan sabit
• Anaerobik
• bakteri rewel
• Keluarga – Selenomonadaceae
• Mereka adalah anaerob dominan di orofaring.

Eubacterium sp.

• Gram-positif
• Batang pleomorfik
• Aerobik atau anaerobik
• Bakteri motil atau non-motil
• Keluarga – Eubacteriaceae
• Mereka adalah mikrobiota aerobik normal dari orofaring.

Flora Normal Saluran Pernafasan Lainnya

Mycoplasma sp.

Ini adalah bakteri yang tidak memiliki dinding sel, sehingga tidak dapat diklasifikasikan berdasarkan pewarnaan Gram (tetapi berwarna merah muda). Mereka adalah bakteri bulat dalam keluarga Mycoplasmataceae. Mycoplasma adalah penghuni normal saluran pernapasan bagian atas tetapi sering terlibat dalam beberapa RTIS. M. salivarium, M. orale, M. amphoriforme, dan M. pneumoniae adalah flora sementara orofaring.

Candida spp.

Candida adalah genus ragi dalam kelas Saccharomycetes. Ini adalah flora normal saluran pernapasan bagian atas, saluran pencernaan, dan saluran reproduksi wanita. C. albicans hadir di orofaring sebagian besar individu.