Bakteri Patogen yang Umum Ditemukan dalam Kotoran

Read Also

Feses adalah bahan makanan yang tidak tercerna dan sisa-sisa lain yang dihasilkan dalam proses pencernaan dan dikeluarkan dari saluran pencernaan melalui anus/kloaka. Kultur feses adalah tes mikrobiologi yang dilakukan untuk mendeteksi mikroorganisme penyebab infeksi saluran cerna. Bakteri, virus, protozoa, dan parasit (cacing) bertanggung jawab atas infeksi pada saluran GI dan organ terkait. Organisme ini dapat dideteksi dalam tinja. Bakteri adalah penyebab umum gastroenteritis termasuk diare, maag, muntah, keracunan makanan, dll. Bakteri penyebab infeksi gastrointestinal dideteksi dengan menumbuhkannya di media kultur menggunakan tinja sebagai sampel. Kotoran penuh dengan flora normal saluran pencernaan, sehingga akan sulit untuk mengisolasi patogen spesifik di antara kontaminasi flora normal.

Daftar Bakteri yang Diisolasi Dari Kotoran

Gram-positive Bacteria in Stool	Gram-negative Bacteria in Stool
Clostridium spp. Staphylococcus spp. Enterococcus spp. Bacillus spp.  Listeria monocytogenes	E. coli Klebsiella spp. Salmonella serovars Shigella spp. Helicobacter pylori Yersinia spp. Proteus spp. Campylobacter spp. Vibrio spp.  Bacteroides spp. Fusobacterium nucleatum

 

Bakteri Gram -ve dan Gram +ve Ditemukan di Kotoran

E.coli pada Kotoran

E. coli adalah Gram-negatif, berbentuk batang, memfermentasi laktosa, anaerobik fakultatif, bakteri koliform mesofilik dari genus Escherichia dalam keluarga Enterobacteriaceae. E. coli adalah flora normal saluran pencernaan manusia, sehingga keberadaannya dalam tinja dianggap normal. Namun, beberapa strain patogen E. coli bertanggung jawab atas penyakit diare yang berbahaya.

Enteropathogenic E. coli (EPEC), Enteroaggregative E. coli (EAEC), Enterohemorrhagic E. coli (EHEC), Enterotoxigenic E. coli (ETEC) {atau Shiga toxin-producing E. coli (STEC) atau Verotoxin producing E. coli (VTEC)}, Enteroinvasive E. coli (EIEC), Diffusely adherent E. coli (DAEC) adalah strain patogen E. coli yang terkait dengan beberapa infeksi saluran cerna termasuk diare.

E. coli O157:H7 (STEC) adalah salah satu penyebab umum diare hemoragik parah dan wabah diare epidemik di seluruh dunia.

Klebsiella spp. di Kotoran

Klebsiella adalah genus bakteri coliform Gram-negatif, berbentuk batang, dan fakultatif anaerobik dan pembentuk kapsul dalam famili Enterobacteriaceae. Klebsiella spp. umum di saluran pencernaan vertebrata. Namun mereka bertanggung jawab untuk gastroenteritis dalam kasus kondisi kekebalan yang lemah atau kasus kerusakan fisik pada saluran GI.

K. pneumoniae adalah spesies umum yang diisolasi dalam tinja pasien dengan penyakit gastrointestinal seperti penyakit Crohn, kolitis ulserativa, dan kanker kolorektal.

K. oxytoca adalah spesies lain yang dilaporkan untuk enteritis hemoragik. K. oxytoca penghasil toksin dilaporkan pada enterokolitis nekrotikans, diare berdarah, dan gastroenteritis lainnya.

K. quasipneumoniae adalah spesies lain yang bertanggung jawab untuk gastroenteritis oportunistik. Hal ini terutama dilaporkan pada pasien yang mikroflora usus alaminya terganggu karena pemberian antibiotik jangka panjang.

Salmonella sp. di Kotoran

Salmonella adalah genus Gram-negatif, berbentuk batang, berflagel, anaerobik fakultatif Gammaproteobacteria dalam famili Enterobacteriaceae. Hal ini umumnya ditemukan di saluran pencernaan manusia dan aspek lingkungan yang terkontaminasi tinja. Salmonella sp. bertanggung jawab atas keracunan makanan, diare, dan demam enterik (demam tifoid).

Serovar S. enterica bertanggung jawab atas beberapa bentuk gastroenteritis pada manusia. S. enterica subspesies enterica serovar Typhi dan Paratyphi bertanggung jawab atas demam enterik (Tifoid dan Paratifoid). Mereka dapat diisolasi dalam tinja pasien dengan demam enterik sebelum pemberian antibiotik.

Non-typhoidal Salmonella (NTS) adalah penyebab utama gastroenteritis di seluruh dunia. Mereka biasanya menyebabkan gastroenteritis self-limiting, tetapi pada bayi dan pasien dengan imunosupresi, kasus ini bisa berakibat fatal. S. enterica serovar Typhimurium, S. enterica serovar Enteritidis adalah serovar paling umum yang terkait dengan gastroenteritis Salmonella.

Shigella spp. di Kotoran

Shigella adalah genus Gram-negatif, berbentuk batang, non-motil, fakultatif anaerobik Gammaproteobacteria dalam keluarga Enterobacteriaceae yang secara genetik terkait dengan E. coli. Ini bertanggung jawab atas infeksi gastrointestinal yang disebut Shigellosis pada manusia dan merupakan penyebab utama diare (disentri basiler) di seluruh dunia.

S. dysenteriae adalah spesies utama penyebab shigellosis. S. dysenteriae subtype 1 (SD1) menghasilkan toksin Shiga. Ini bertanggung jawab untuk bentuk Shigellosis yang paling parah seperti disentri parah dengan komplikasi sistemik seperti ketidakseimbangan elektrolit, kejang, dan hemolytic uremic syndrome (HUS) dan memiliki angka kematian tertinggi.

S. flexneri adalah spesies umum lain yang menyebabkan shigellosis. Ini bertanggung jawab untuk sebagian besar shigellosis di Asia Tenggara. Ini sebagian besar menyebabkan bentuk diare yang lebih ringan tetapi dalam beberapa kasus, mereka dilaporkan untuk bentuk yang parah termasuk HUS dan kejang.

S. sonnei dan S. boydii bertanggung jawab atas bentuk Shigellosis yang lebih ringan.

Vibrio spp. di Kotoran

Vibrio adalah genus Gram-negatif, berbentuk batang (berbentuk koma), motil, non-spora, fakultatif anaerobik Gammaproteobacteria dalam keluarga Vibrionaceae dengan karakteristik 2 kromosom. Ini bertanggung jawab untuk gastroenteritis yang ditularkan melalui air.

V. cholerae adalah spesies patogen terpenting yang bertanggung jawab atas wabah kolera. Hal ini bertanggung jawab untuk kolera endemik di sekitar 69 negara. Strain yang mampu menghasilkan enterotoksin Kolera menyebabkan bentuk kolera yang parah dengan kematian >50% jika tidak diobati. V. cholerae O1 dan O139 adalah serotipe yang paling umum menyebabkan wabah kolera epidemik.

V. parahaemolyticus adalah spesies Vibrio kedua yang paling umum menyebabkan gastroenteritis bakteri, sebagian besar di wilayah Asia. Namun, tingkat keparahannya sangat kurang dari infeksi V. cholerae.

V. vulnificus adalah spesies lain yang bertanggung jawab atas bentuk gastroenteritis yang lebih ringan dengan diare, muntah, dan demam.

Helicobacter pylori di Kotoran

Helicobacter adalah genus Gram-negatif, heliks, mikroaerofilik Epsilonproteobacteria dalam keluarga Helicoceteriaceae. Mereka diadaptasi untuk mentolerir keasaman lambung manusia.

H. pylori biasanya ada di duodenum kebanyakan manusia. Tetapi dalam beberapa kasus, mereka dapat menyebabkan peradangan gastrointestinal, gastritis, maag, diare, kanker lambung, dan masalah pencernaan lainnya.

Yersinia spp. di Kotoran

Yersinia adalah genus Gram-negatif, coccobacilli, fakultatif anaerobik Gammaproteobacteria dalam keluarga Yersiniaceae.

Y. enterocolitica dikaitkan dengan sekitar 2% gastroenteritis. Hal ini biasanya diremehkan karena sebagian besar kasus sembuh sendiri, tetapi kasus gastroenteritis Y. enetrocolitica biasanya tinggi pada anak-anak dan dewasa muda.

Insiden gastroenteritis terkait Y. pestis relatif rendah.

Y. pseudotuberculosis adalah spesies lain yang sangat jarang menyebabkan infeksi bawaan makanan pada manusia, terutama di tempat dingin.

Proteus sp. di Kotoran

Proteus adalah genus bakteri gram negatif, berbentuk batang, aerobik, dan anaerobik fakultatif dalam famili Enterobacteriaceae yang terkenal karena koloninya yang berkerumun. Proteus sp. bertanggung jawab untuk gastroenteritis, radang usus buntu, penyakit Crohn, kolitis, dan kolonisasi tabung nasogastrik.

 P. mirabilis adalah spesies Proteus yang paling umum pada gastroenteritis. P. vulgaris dan P. penneri jarang terlibat dalam infeksi gastrointestinal.

Clostridium sp. di Kotoran

Clostridium adalah genus bakteri Gram-positif, berbentuk batang, anaerobik, pembentuk spora dalam famili Clostridiaceae.

C. difficile merupakan salah satu penyebab utama diare nosokomial. Strain penghasil toksin bertanggung jawab atas beberapa bentuk gastroenteritis, sebagian besar diare, dan kolitis.

C. perfringens adalah spesies lain yang terkait dengan infeksi gastrointestinal akut. Ini bertanggung jawab atas kasus keracunan makanan. Ini menyebabkan diare ringan hingga enterokolitis nekrotikans berat. Mereka menghasilkan racun Tipe A dan Tipe C yang bertanggung jawab untuk penyakit diare.

Staphylococcus spp. di Kotoran

Staphylococcus adalah genus bakteri kokus Gram-positif, katalase-positif, milik keluarga Staphylococcaceae, biasanya dikenal untuk memproduksi kelompok seperti anggur di bawah mikroskop. Mereka adalah flora normal kulit.

S. aureus adalah patogen manusia utama yang memproduksi Staphylococcal enterotoxins (SEs) yang mengakibatkan keracunan makanan Staphylococcal. Ini adalah salah satu penyebab utama keracunan makanan.

Enterococcus spp dalam Kotoran

Enterococcus adalah genus Gram-positif, anaerobik fakultatif, bakteri kokus (diplococci) yang memfermentasi laktosa dalam famili Enterococcaceae yang memiliki kapasitas untuk mentolerir konsentrasi garam empedu hingga 40%. Mereka komensal ke saluran GI dan jarang berhubungan dengan infeksi gastrointestinal. Mereka berhubungan dengan infeksi intra-abdominal dan gastritis. E. hirae dan E. Durans terdeteksi sebagai penyebab gastritis di beberapa. E. faecalis yang resisten terhadap vankomisin adalah spesies lain yang bertanggung jawab atas beberapa kasus gastroenteritis.

Campylobacter sp. di Kotoran

Campylobacter adalah genus Gram-negatif, berbentuk batang (koma), bakteri motil mikroaerofilik dalam keluarga Campylobacteraceae. Hal ini bertanggung jawab untuk infeksi gastrointestinal bakteri yang disebut Campylobacteriosis.

C. jejuni adalah salah satu penyebab paling umum dari gastroenteritis bakteri akut pada anak-anak dan orang dewasa. Ini menyebabkan diare, muntah, dan sakit perut.

Listeria sp. di Kotoran

Listeria adalah genus bakteri Gram-positif, berbentuk batang, tidak berspora, anaerobik fakultatif dalam famili Listeriaceae. Ini bertanggung jawab untuk penyakit yang disebut listeriosis.

L. monocytogenes dapat menyebabkan gastroenteritis demam akut, sembuh sendiri, dan gastroenteritis invasif. Listeria gastroenteritis memiliki angka kematian yang sangat tinggi menjadikannya penyakit bawaan makanan dengan angka kematian tertinggi ketiga.

Bacteroides sp. di Kotoran

Bacteroides adalah genus Gram-negatif, berbentuk batang, tahan empedu, tidak berspora, motil atau non-motil, bakteri anaerob obligat dalam keluarga Bacteroidaceae. Mereka adalah bagian dari mikroflora gastrointestinal manusia.

B. fragilis adalah satu-satunya spesies yang dilaporkan membentuk abses di usus. Mereka memiliki kapsul dan menghasilkan racun yang dapat menyebabkan kerusakan jaringan. Jika tidak diobati mereka mengganggu dinding usus dan menyebabkan sepsis intra-abdominal dan radang usus buntu. Ini memiliki tingkat kematian 19%, dan ketika tidak diobati meningkat menjadi 60%.

Fusobacterium nucleatum di Kotoran

Fusobacterium adalah genus Gram-negatif, non-spora, bakteri anaerob berbentuk batang dalam keluarga Fusobacteriaceae. F. nucleatum ditemukan berhubungan dengan kanker kolorektal.

Bacillus sp. di Kotoran

Bacillus adalah genus bakteri Gram-positif, berbentuk batang, pembentuk endospora, aerob atau anaerob fakultatif dalam famili Bacillaceae.

B. cereus adalah salah satu patogen umum yang bertanggung jawab atas keracunan makanan. Ini menghasilkan sindrom muntah atau sindrom diare.