Mikrobioma Manusia Dan Flora Normal Tubuh Manusia

Read Also

Melalui aktivitas normal sehari-hari, tubuh manusia terpapar mikroorganisme di lingkungan. Ratusan spesies dan sel mikroba individu yang tak terhitung jumlahnya, secara kolektif disebut mikroflora normal, tumbuh pada atau di dalam tubuh manusia. Ini adalah mikrobioma manusia, jumlah total semua mikroorganisme yang hidup di atau di dalam tubuh manusia.

• Mikroflora normal telah mengembangkan hubungan simbiosis dengan inang mamalia.

• Mereka berkontribusi pada kesehatan dan kesejahteraan inang dengan menghasilkan produk mikroba yang bermanfaat dan menghambat pertumbuhan mikroorganisme berbahaya.

• Pada gilirannya, tuan rumah menyumbangkan berbagai lingkungan mikro yang mendukung pertumbuhan mikroba.

• Mikroflora normal pertama kali diperkenalkan saat lahir.

Mikrobiota Kulit Normal

• Kulit adalah organ terbesar tubuh manusia, dijajah oleh beragam mikroorganisme, yang sebagian besar tidak berbahaya atau bahkan bermanfaat bagi inangnya.

• Karena paparan konstan dan kontak dengan lingkungan, kulit terutama cenderung mengandung mikroorganisme sementara.

• Namun demikian, ada flora residen yang konstan dan terdefinisi dengan baik, dimodifikasi di area anatomis yang berbeda oleh sekresi, kebiasaan memakai pakaian, atau kedekatan dengan selaput lendir (mulut, hidung, dan daerah perineum).

Mikroorganisme residen yang dominan pada kulit adalah:

Staphylococcus epidermidis

Staphylococcus aureus (dalam jumlah kecil)

Spesies Micrococcus

α-Hemolytic dan nonhemolytic streptococci (misalnya, Streptococcus mitis)

spesies Corynebacterium

Spesies Propionibacterium

Spesies Peptostreptococcus

spesies Acinetobacter

Sejumlah kecil organisme lain (spesies Candida, Pseudomonas aeruginosa, dll)

Mikrobiota Normal Mulut dan Saluran Pernapasan Atas

• Flora hidung terdiri dari corynebacteria yang menonjol, stafilokokus (S epidermidis, S aureus), dan streptococci

• Berbeda langsung dengan komunitas ibu mereka yang sangat berbeda, neonatus menyimpan komunitas bakteri yang tidak terdiferensiasi di berbagai habitat tubuh, terlepas dari mode pengiriman.

• Dengan demikian, pada tahap awal pengembangan masyarakat (<5 menit pasca pengiriman), manusia

• mikrobiota didistribusikan secara homogen ke seluruh tubuh.

• Bayi yang dilahirkan melalui vagina mengandung komunitas bakteri (di semua habitat tubuh) yang komposisinya paling mirip dengan komunitas vagina ibu; Bayi seksio sesarea kekurangan bakteri dari komunitas vagina (misalnya, Lactobacillus, Prevotella, Atopobium, dan Sneathia spp.).

• Bayi yang dilahirkan melalui bedah Caesar mengandung komunitas bakteri (di semua habitat tubuh) yang paling mirip dengan komunitas kulit ibu (misalnya, Staphylococcus, Corynebacterium, atau Propionibacterium spp.).

• Di awal kehidupan, stafilokokus aerobik dan anaerobik, diplokokus gram negatif (Neisseriae, Moraxella catarrhalis), difteri, dan kadang-kadang lactobacilli ditambahkan.

• Ketika gigi mulai erupsi, spirochetes anaerobik, spesies Prevotella (terutama Prevotella melaninogenica), spesies Fusobacterium, spesies Rothia, dan spesies Capnocytophaga membentuk dirinya bersama dengan beberapa vibrio anaerob dan lactobacilli.

• Spesies Actinomyces biasanya terdapat pada jaringan tonsil dan pada gingiva pada orang dewasa, dan berbagai protozoa juga mungkin ada.

• Ragi (spesies Candida) terjadi di mulut.

• Organisme yang dominan di saluran pernapasan bagian atas, terutama faring, adalah streptokokus non-hemolitik dan α-hemolytic streptococci adan Neisseriae. Staphylococci, difteri, hemofilia, pneumokokus, mikoplasma, dan prevotella juga ditemukan.

Mikrobiota Normal Saluran Usus

• Saluran pencernaan manusia dibagi menjadi beberapa bagian, yang memungkinkan pencernaan dan penyerapan nutrisi di wilayah proksimal terpisah dari populasi mikroba besar di usus besar.

• Saat lahir, usus steril, tetapi organisme segera diperkenalkan dengan makanan.

• Lingkungan (misalnya, mikrobiota vagina, tinja, atau kulit ibu) merupakan faktor utama dalam menentukan profil mikroba awal.

• Banyak penelitian awal melaporkan bahwa mikrobiota usus anak-anak yang disusui didominasi oleh Bifidobacteria.

• Namun, penelitian terbaru menggunakan microarrays dan PCR kuantitatif menunjukkan bahwa pada kebanyakan bayi, Bifidobacteria tidak muncul sampai beberapa bulan setelah lahir dan setelah itu bertahan sebagai populasi minoritas.

• Pada anak-anak yang diberi susu botol, flora yang lebih beragam ada di usus, dan lactobacilli kurang menonjol.

• Saat kebiasaan makan berkembang ke arah pola dewasa, flora usus berubah.

• Diet memiliki pengaruh yang nyata pada komposisi relatif flora usus dan feses.

• Misalnya, individu dengan pola makan hewani telah terbukti memiliki peningkatan kelimpahan mikroorganisme toleran empedu (Alistipes, Bilophilia, dan Bacteroides) dan penurunan kadar Firmicutes yang memetabolisme polisakarida tanaman makanan (Roseburia, Eubacterium rectale, dan Ruminococcus bromii). ).

• Usus bayi baru lahir di ruang perawatan intensif cenderung dijajah oleh Enterobacteriaceae, seperti Klebsiella, Citrobacter, dan Enterobacter.

• Dari ratusan filotipe yang terdeteksi di perut manusia, hanya Helicobacter pylori yang bertahan di lingkungan ini.

• Di usus bagian atas, populasi bakteri yang terkait dengan mukosa termasuk filum Bacteroidetes dan anggota Clostridiales, dan mereka yang ada di lumen dapat mencakup anggota Enterobacteriales dan enterococci.

• Dalam usus besar dewasa normal, 96-99% dari flora bakteri residen terdiri dari anaerob.

• Enam filum utama mendominasi; ini adalah Bacteroidetes, Firmicutes, Actinobacteria, Verrucomicrobiota, Fusobacteria, dan Proteobacteria.

Mikrobiota Normal Uretra

• Uretra anterior dari kedua jenis kelamin mengandung sejumlah kecil jenis organisme yang sama yang ditemukan pada kulit dan perineum.

• Di uretra anterior manusia, S. epidermidis, enterococci, dan diphtheroid sering ditemukan; E. coli, Proteus, dan Neisseria (spesies nonpatogen) dilaporkan kadang-kadang (10 sampai 30 persen).

• Karena flora normal berada di uretra, perawatan harus dilakukan dalam menafsirkan kultur urin secara klinis; sampel urin mungkin mengandung organisme ini pada tingkat 104/ml jika spesimen aliran tengah (tangkapan bersih) tidak diperoleh.

Mikrobiota Normal Vagina

• Setelah lahir, lactobacilli aerobik muncul di vagina dan bertahan selama pH tetap asam (beberapa minggu).

• Ketika pH menjadi netral (tetap demikian sampai pubertas), terdapat campuran flora kokus dan basil.

• Saat pubertas, laktobasilus aerob dan anaerob muncul kembali dalam jumlah besar.

• Setelah menopause, jumlah laktobasilus kembali berkurang, dan flora campuran kembali.

• Flora vagina normal termasuk streptokokus grup B pada sebanyak 25% wanita usia subur.

• Flora vagina normal sering juga termasuk streptokokus -hemolitik, streptokokus anaerobik,

• (peptostreptococci), spesies Prevotella, clostridia, Gardnerella vaginalis, Ureaplasma urealyticum, dan kadang-kadang spesies Listeria atau Mobiluncus.

• Lendir serviks memiliki aktivitas antibakteri dan mengandung lisozim.

• Pada beberapa wanita, introitus vagina mengandung flora berat yang menyerupai perineum dan daerah perianal.

• Ini mungkin menjadi faktor predisposisi infeksi saluran kemih berulang.

• Organisme vagina yang ada pada saat persalinan dapat menginfeksi bayi baru lahir (misalnya, streptokokus grup B).

Mikrobiota Normal Konjungtiva

• Organisme yang dominan pada konjungtiva adalah difteri, S epidermidis, dan nonhemolytic streptococci.

• Neisseriae dan basil gram negatif yang menyerupai hemofilia (spesies Moraxella) juga sering ditemukan.

• Flora konjungtiva biasanya ditahan oleh aliran air mata, yang mengandung lisozim antibakteri.